hyperrefをインポートしていると，右と下の余白が切り詰められるのを発見． 原因を調べてみると，余白が切り詰められているのではなく，用紙サイズが変わっているのでした． TeX で PDF 作成の注意点 – Iranoan

hyperrefの内部指定はdvipdfmxの用紙サイズ指定オプションより優先されるので，パッケージのインポート後に設定を上書きするしかない模様．

\usepackage[dvipdfmx]{hyperref}
\special{papersize=210mm,297mm}